Hochschulpraktikum "Datenanalyse Genomik/Proteomik Von Pflanzenwachstumstimulierenden Bakterien"

Über den Job

Diesen Beitrag können Sie leisten

• Mithilfe bei der Analyse von mikrobiellen Proteomikdaten; Integration mit Genomsequenzdaten
• Mithilfe bei der Genomassemblierung von Bakterien anhand von Next Generation Sequenzierungsdaten (Illumina, PacBio, ONT)
• Zusätzliche Mithilfe bei der Analyse von anderen OMICS Daten (RNA-Seq, Tn-Seq)
• Beiträge zu Forschungsprojekten (inkl. Publikationen) des Teams Mikrobielle Genomik und Bioinformatik
• Mithilfe bei Unterhalt und Erweiterung der Funktionalität bestehender Datenanalysepipelines (Proteomik, Genomassemblierung)

Das macht Sie einzigartig

• Kürzlich (weniger als 10 Monate her) erworbener Masterabschluss (Uni, ETH, FH)
• Motivierter Wissenschaftler mit Erfahrung/Abschluss in Computational Biology/Bioinformatik
• Sehr gute Programmierkenntnise (Python/R); Erfahrung im Bereich der Analyse von funktionellen Genomikdaten ist ein Vorteil
• Ausgewiesener Teamplayer mit guter Kommunikationsfähigkeit
• Kenntnisse zweier Amtssprachen und des Englischen

Auf den Punkt gebracht

Wir suchen eine motivierte und engagierte Person, die Freude daran hat, funktionelle Genomikdaten (vor allem Genomsequenz- und Proteomikdaten, ggfalls. Auch RNA-seq und Tn-seq Daten) zu analysieren und zu integrieren und dazu beiträgt die Mechanismen zu verstehen, die es Bakterien erlauben einerseits das Pflanzenwachstum zu stimulieren und zusätzlich das Wachstum schädlicher Pflanzenpathogene zu verhindern. Wir bieten eine abwechslungsreiche und internationale Umgebung, guten Teamgeist, und praxisnahe, innovative Forschung.

Zusätzliche Informationen

Als Bestandteil der biologischen Vielfalt und mit ihren verschiedenen Funktionen tragen alle Lebewesen zur Funktion und Stabilität von Ökosystemen bei. Viele ihrer Eigenschaften sind in ihrem Erbgut festgelegt. Die Forschungsgruppe Molekulare Agrar- und Pflanzenökologie bearbeitet und unterstützt wissenschaftliche Forschungsprojekte zur genetischen und genomischen Vielfalt mit modernsten molekularbiologischen, bioinformatischen und biostatistischen Ansätzen. Das Team 'Mikrobielle Genomik und Bioinformatik' am Standort Reckenholz arbeitet mit "state-of-the-art" funktionellen Genomikdaten. Es setzt sich zum Ziel, Software Tools zu entwickeln und Forschung auszuüben die Forscher dabei unterstützen Erkenntnisse aus der Grundlagenforschung schrittweise in praktische Anwendungen einfliessen zu lassen, und so einen Mehrwert für die angewandte Forschung zu generieren.