Agroscope ist das Schweizer Kompetenzzentrum für Forschung in Landwirtschaft, Ernährung und Umwelt. Wir haben eine Stelle für eine/n motivierte/n Postdiplom-Student/in, die/der SO SCHNELL WIE MÖGLICH einsteigen kann.

Wir suchen eine engagierte Person, die Freude daran hat, funktionelle Genomik-Daten (vorwiegend Genomsequenz- und Proteomik-Daten, eventuell auch RNA-seq- und Tn-seq-Daten) zu analysieren und zu integrieren und uns dabei helfen kann, die Mechanismen zu verstehen, die es Bakterien ermöglichen, sowohl das Pflanzenwachstum zu fördern als auch das Wachstum schädlicher Pflanzenpathogene zu hemmen. Wir bieten ein vielfältiges und internationales Umfeld, einen starken Teamgeist und praxisnahe, innovative Forschung. Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an Dr. Christian Ahrens, Teamleiter Mikrobielle Genomik & Bioinformatik (Molekulare Ökologie Gruppe, Agroscope) und Gruppenleiter am SIB Swiss Institute of Bioinformatics (

https://www.sib.swiss

Aufgaben

• Analyse mikrobieller Proteomik-Daten; Integration mit Genominformationen
• Genomassemblierung von Bakterien unter Verwendung von NGS-Daten (Illumina, PacBio, Oxford Nanopore Technologies) und Genomannotation
• Unterstützung bei der Analyse weiterer OMICS-Daten (RNA-Seq, Tn-Seq)
• Mitarbeit an Forschungsprojekten (einschließlich Publikationen) des Teams Mikrobielle Genomik und Bioinformatik
• Wartung & Erweiterung von Datenanalyse-Pipelines (Proteomik, Genomassemblierung)

Profilanforderungen

• Kürzlich (vor weniger als 10 Monaten) abgeschlossener Masterabschluss (ETH oder Universität, FH)
• Motivierte/r Wissenschaftler/in mit Hintergrund/Abschluss in Bioinformatik/Computational Biology
• Ausgezeichnete Programmierkenntnisse (Python/R); Erfahrung in der Analyse funktioneller Genomik-Daten ist von Vorteil
• Starke Teamfähigkeit mit guten Kommunikationsfähigkeiten
• Kenntnisse in (idealerweise) zwei offiziellen Schweizer Landessprachen und sehr gute Englischkenntnisse

Bewerbung

Wenn Sie an dieser herausfordernden und hochinteressanten Position interessiert sind, senden Sie bitte Ihre Bewerbung inklusive Lebenslauf und Motivationsschreiben an:

christian.ahrens@agroscope.admin.ch