Phd In Quantitative Microbial Biosignatures And Statistical Biophysics

Einführung

Die UNIL ist eine führende internationale Lehr- und Forschungseinrichtung mit über 5.000 Mitarbeitenden und 17.000 Studierenden, verteilt auf den Campus Dorigny, das CHUV und Epalinges. Als Arbeitgeber fördert die UNIL Exzellenz, individuelle Anerkennung und Verantwortung.

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NCCR GENESIS - Vollfinanzierte PhD-Stelle

Das Nationale Kompetenzzentrum für Forschung NCCR Genesis ist ein vom SNSF finanziertes Forschungsinfrastrukturprojekt, das sich auf die Erforschung des Ursprungs des Lebens im Universum konzentriert. Diese interdisziplinäre Forschungsinfrastruktur bringt Physiker, Erd- und Planetenwissenschaftler, Chemiker und Biologen zusammen, um die Bedingungen und Mechanismen zu verstehen, die das Entstehen von Leben ermöglichen. Die Entwicklung zuverlässiger Methoden zur Erkennung verlässlicher Lebensspuren (Biosignaturen) – sei es durch Fernerkundung oder direkte Messungen vor Ort – erfordert bedeutende Innovationen. Diese Herausforderungen verlangen eine enge Zusammenarbeit zwischen Physik, Biologie, Chemie und Geowissenschaften. NCCR Genesis hat nicht das Ziel, in allen Bereichen Antworten zu liefern, sondern innovative Forschung voranzutreiben und entscheidende Fortschritte zu erzielen.

Details zu NCCR Genesis sind auf der Webseite verfügbar

https://nccr-genesis.ch

NCCR Genesis verpflichtet sich stark zu Gleichstellung, Vielfalt und Inklusion. Unser Ziel ist es, eine respektvolle und faire Arbeitskultur mit gleichem Zugang zu beruflicher Entwicklung und Unterstützung für alle zu fördern. Wir ermutigen ausdrücklich Bewerbungen von unterrepräsentierten Gruppen.

Das Institut für Erdwissenschaften (ISTE) der Universität Lausanne lädt Bewerbungen für eine PhD-Stelle im Bereich computergestützter Biosignaturen und quantitativer Modellierung im Rahmen des NCCR Genesis ein. Die erfolgreiche Kandidatin/der erfolgreiche Kandidat wird unter gemeinsamer Betreuung von Alice Bosco Santos (UNIL) und Paolo De Los Rios (EPFL) arbeiten.

Präsentation

Dieses PhD-Projekt zielt darauf ab, zu quantifizieren, wie virale Störungen des mikrobiellen Stoffwechsels in sauerstoffarmen Umgebungen in messbare Biosignaturen übersetzt werden.

Mit Fokus auf schwefelzyklische mikrobielle Gemeinschaften (z. B. Purpurschwefelbakterien und assoziierte Viren) wird das Projekt Bioinformatik, quantitative Modellierung und Integration experimenteller Daten kombinieren, um zentrale metabolische Kontrollpunkte zu identifizieren, die von Viren angegriffen werden, und zu bewerten, wie deren Störung sich durch mikrobielle und biogeochemische Systeme ausbreitet und nachweisbare Veränderungen in Biosignaturen (z. B. Isotopische Fraktionierung, Pigmentproduktion) hervorruft.

Ihre Aufgaben

Die erfolgreiche Kandidatin/der erfolgreiche Kandidat wird Multi-Omics-Datensätze analysieren, darunter Metagenome, Metatranskriptome, Virome und virale auxiliary metabolic genes (AMGs), um zu untersuchen, wie virale Infektionen den mikrobiellen Stoffwechsel umgestalten. Das Projekt umfasst die Identifikation von Stoffwechselwegen (KEGG-Pfade) und geschwindigkeitsbestimmenden Reaktionen, die von Viren angegriffen werden, die Integration dieser Daten in quantitative Modelle, die mikrobielle Stoffwechselnetzwerke simulieren, die Quantifizierung der Auswirkungen viraler Störungen und die Abschätzung der Schwellenwerte, bei denen virale Aktivität nachweisbare Veränderungen der Biosignaturen hervorruft. Die Kandidatin/der Kandidat wird zur Interpretation des Kohlenstoff- und Schwefelkreislaufs in natürlichen Umgebungen beitragen, an Feldkampagnen teilnehmen, um sich mit den untersuchten Ökosystemen vertraut zu machen, und die Möglichkeit haben, an Laborversuchen wie Genexpressionsanalysen teilzunehmen, um die quantitativen Modelle zu validieren und zu parametrisieren.

Ihre Qualifikationen

Wir suchen eine motivierte Kandidatin/einen motivierten Kandidaten, die/der sich für die Schnittstelle von Biologie, Physik und Erdwissenschaften interessiert und eine starke Neigung zu computergestützten Ansätzen hat. Sie müssen einen MSc (oder gleichwertig) in Bioinformatik, computergestützter Biologie, Physik, Umweltwissenschaften oder einem verwandten Fach besitzen. Sie sollten ein starkes Interesse an quantitativer Analyse und Modellierung, Programmierkenntnisse und die Fähigkeit haben, an der Schnittstelle verschiedener Disziplinen zu arbeiten. Wir suchen eine Kandidatin/einen Kandidaten, die/der Interesse daran hat, Modelle mit experimentellen Daten zu verknüpfen.

Wir engagieren uns für die Förderung eines gerechten, vielfältigen und inklusiven Forschungsumfelds. Wir ermutigen insbesondere Bewerbungen von Personen, die in der Wissenschaft unterrepräsentiert sind, einschließlich solcher mit vielfältigem kulturellem und ethnischem Hintergrund sowie solchen, die unkonventionelle akademische Wege eingeschlagen haben. Wir sind überzeugt, dass Vielfalt unsere Wissenschaft stärkt, und streben aktiv den Aufbau eines inklusiven und unterstützenden Teams an.

Was die Stelle Ihnen bietet

Die Kandidatin/der Kandidat wird an der Universität Lausanne angesiedelt sein und eng mit der EPFL zusammenarbeiten. Das Projekt bietet ein hochgradig interdisziplinäres Umfeld an der Schnittstelle von mikrobieller Ökologie, Physik und Erdwissenschaften.

Wir bieten einen angenehmen Arbeitsplatz in einem multikulturellen, vielfältigen und dynamischen akademischen Umfeld. Möglichkeiten zur beruflichen Weiterbildung, zahlreiche Aktivitäten und weitere Vorteile warten darauf, entdeckt zu werden.

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Kontakt für weitere Informationen

Dr. Alice Bosco Santos – alice.boscosantos@unil.ch

Ihre Bewerbung

Frist: 20.08.2026

Bitte senden Sie Ihre vollständige Bewerbung in Word oder PDF:

• Ein Anschreiben, das Ihre Forschungs­motivation und Interessen darlegt (max. 1 Seite);
• Ihren Lebenslauf mit akademischem Hintergrund, bisherigen Forschungsarbeiten/Publikationen und/oder industriellen Erfahrungen sowie die Namen und Kontaktdaten von 2-3 Referenzpersonen;
• Kopien Ihrer Diplome.

Nur Bewerbungen über diese Webseite werden berücksichtigt.

Wir danken für Ihr Verständnis.

Zusätzliche Informationen

Die UNIL verpflichtet sich zu: Gleichstellung, Vielfalt und Inklusion innerhalb ihrer Gemeinschaft; Sicherstellung eines offenen und respektvollen Umfelds, das persönliche Entwicklung fördert; Angebot von Arbeitsbedingungen, die eine Work-Life-Balance erleichtern; Unterstützung von Nachwuchswissenschaftlerinnen und -wissenschaftlern.

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