PhD Student Position In Deep Learning For Enzyme Structure & Catalysis

Einleitung

Die UNIL ist eine führende internationale Lehr- und Forschungseinrichtung mit über 5.000 Mitarbeitenden und 17.000 Studierenden, verteilt auf den Campus Dorigny, das CHUV und Epalinges. Als Arbeitgeber fördert die UNIL Exzellenz, individuelle Anerkennung und Verantwortung.

unil.ch/arbeit

Präsentation

Wir suchen eine Doktorandin oder einen Doktoranden zur Entwicklung von Deep-Learning-Methoden zur Modellierung biomolekularer Interaktionen im Kontext der Katalyse. Protein-Ligand-Cofolding-Modelle zielen darauf ab, Proteinstrukturen und die Bindungspositionen kleiner Moleküle gemeinsam vorherzusagen. Die Enzymkatalyse stellt eine andere Herausforderung dar: Molekulare Interaktionen müssen im Kontext der katalysierten chemischen Reaktion und der Dynamik der beteiligten Veränderungen verstanden werden. Das Projekt untersucht, wie Protein-Ligand-Cofolding-Ansätze erweitert werden können, um Enzyme und ihre Reaktionen besser zu modellieren, mit besonderem Interesse an Methoden, die über Enzymfamilien und chemische Transformationen generalisieren. Das Projekt kombiniert Deep Learning, Protein-Bioinformatik und groß angelegte Analysen von Proteinsequenzen, Strukturen und biochemischen Daten. Es besteht die Möglichkeit, Modellentwicklung und -bewertung, Repräsentationslernen sowie Anwendungen auf katalytische Funktionen und molekulares Design zu erforschen. Für einen Überblick über unsere Forschungsinteressen siehe pickybinders.org.

Stelleninformationen

Beginn der Stelle: Frühestens November 2026, nach Vereinbarung
Vertragsdauer: 1 Jahr, verlängerbar, maximal 5 Jahre
Beschäftigungsgrad: 100%
Arbeitsort: Universität Lausanne, Campus Dorigny

Ihre Qualifikationen

Wir suchen
● Einen Masterabschluss in Informatik, Computational Biology, Bioinformatik, Machine Learning, Chemie, Biochemie oder einem verwandten Fach
● Gute Programmierkenntnisse, vorzugsweise in Python
● Interesse an Machine Learning und Proteinen
● Neugier auf die Beziehung zwischen molekularer Sequenz, Struktur und biochemischer Funktion
● Motivation, Forschungsansätze eigenständig zu entwickeln und zu verfolgen sowie neue Themen und Techniken zu erlernen.
Erfahrungen mit Deep Learning, Strukturbiologie, Cheminformatik oder Protein-Bioinformatik sind nützlich, aber nicht erforderlich. Wir erwarten nicht, dass Bewerbende bereits Expertise in allen diesen Bereichen besitzen.

Was die Stelle Ihnen bietet

Wir bieten einen angenehmen Arbeitsplatz in einem multikulturellen, vielfältigen und dynamischen akademischen Umfeld. Möglichkeiten zur beruflichen Weiterbildung, viele Aktivitäten und weitere Vorteile warten auf Sie.

unil.ch/arbeit

Kontakt für weitere Informationen

Prof. Janani Durairaj, E-Mail: janani.durairaj@unil.ch 

Ihre Bewerbung

Bewerbungsfrist: laufend

Bitte senden Sie Ihre vollständige Bewerbung als einzelnes PDF-Dokument, das Folgendes enthält:
● einen Lebenslauf
● ein kurzes Anschreiben, in dem Sie Ihre Forschungsinteressen, relevante Erfahrungen und Ihre Motivation für das Projekt beschreiben
● die Namen von zwei Referenzpersonen
Bewerbungen werden fortlaufend geprüft, bis die Stelle besetzt ist.
Wir ermutigen Bewerbungen von Kandidatinnen und Kandidaten aus unterrepräsentierten Gruppen in den Computational Sciences.

Nur Bewerbungen über diese Webseite werden berücksichtigt.
Wir danken für Ihr Verständnis.

Zusätzliche Informationen

Die UNIL verpflichtet sich zu:
• Gleichstellung, Vielfalt und Inklusion innerhalb ihrer Gemeinschaft;
• Sicherstellung eines offenen und respektvollen Umfelds, das persönliche Entwicklung fördert;
• Angebot von Arbeitsbedingungen, die eine Work-Life-Balance ermöglichen;
• Unterstützung von Nachwuchsforschenden.

unil.ch/gleichstellung

unil.ch/familien

unil.ch/graduatecampus